顾名思义，同步推出的2025款MT-07 Y-AMT、就是配备了Y-AMT（Yamaha Automated Manual Transmission，Yamaha手自一体变速箱）的版本，这是继MT-09之后、首次在CP2动力平台上搭载该系统的车型。
2025款MT-07 Y-AMT版没有位于左边的离合操纵杆（离合牛角）和换档操作杆，通过车把左边的按键对换档进行操作；
骑士可以选择MT手动换档，或者是在 D、D + 这两个自动档模式之间进行选择，其中D档适应于日常骑行、提供一个平衡的自动换档功能，而D+档则用于提供更具运动性的骑行，会在更高的转速才会进行自动换档。
此外，Y-AMT系统会与车辆本身的YRC电子辅助骑行系统进行协同工作，进一步协调动力特性和牵引力控制的设置，以匹配骑士所希望的控制类型。
与标准版的2025款MT-07相比，Y-AMT还具有巡航控制功能，可为骑士在中、长途的驾驶过程中，提供一个更轻松的骑行体验，对于这样的的一款车你是否会选择呢？