从整体改动来看，2025款川崎Z900属于进化式升级，并非大刀阔斧的革新。在细节方面，它进行了一系列调整，比如优化骑行姿势、采用电子油门，由此新增定速巡航功能；配备新的快速换挡器；悬挂重新调教；换上新的TFT彩色显示屏。此外，还推出了SE版车型，配备Brembo刹车、奥林斯减震和全可调前减等高端配件。
 
发动机作为摩托车的核心，2025款Z900的948CC直列四缸发动机改动最多。它采用新凸轮轴、改进空滤设计并使用全新电子油门系统。这些升级让发动机在9500转时可输出124马力，7700转时达到97.4牛米最大扭矩，同时油耗理论上降低至百公里4.8升，不过实际油耗在百公里6 - 6.5升。川崎没有盲目追求动力提升，而是通过电子油门让动力输出更平顺，还利于满足排放标准。并且，降低了所有六个档位的传动比，配合快速换挡装置，让换挡更轻松，只是第六档传动比降低使得极速比上一代略低，但加速性能更好。
 
车架方面变化较小，依旧是双摇篮式钢管编织车架，前减上三星位置下降几毫米，以此给车头增加重量，优化重量分布。悬挂部分，41毫米倒置前减行程120毫米，后单减震行程140毫米，均支持回弹和预载调节。座椅高度有所增加，达到830毫米，不过也保留了810毫米的低座椅选项。
 
电控系统堪称2025款Z900的一大亮点。新增的六轴IMU实现弯道ABS和倾角感应牵引力控制，让电子系统能精准微调，骑行模式也增加到四种，包括运动、公路、雨天和自定义模式。运动模式下技术好的骑手能做出小幅度翘头动作，公路模式则更保守平稳。标配的双向快速换挡系统可在1500转以上双向操作，与整车骑行体验融合度高，运行顺滑。
刹车系统也得到改进，前轮采用镜像安装的侧滑胎卡钳，虽刹车盘尺寸未变（前轮300毫米、后轮250毫米单刹车盘 ），但制动性能有所提升。轮胎尺寸为前轮120/70ZR17、后轮180/55ZR17，原厂轮胎属于全能型，侧重安全，但质地硬、减震性差，追求运动感的骑手可更换为更专业的运动型轮胎。
 
与本田CB1000黄蜂相比，Z900在电控系统上更具优势，配备六轴IMU，而本田采用的是相对低端的系统。不过本田发动机功率更大，达到152马力，且车身稍轻，只是油耗略高。