川崎ZX4RR存在一些缺点，该车低扭较弱，在市区走走停停的路况或低转速行驶时，动力输出不够强劲，需要拉高转速才能获得较好的动力，这对于习惯低转速骑行的人来说不太友好。大陆版牙盘调校使得车辆在不同转速下动力表现差异大，在一万转以前动力较弱，超过一万转动力爆发，但超过一万两千转动力又变弱，动力输出不够线性，在城市道路行驶时难以把控。前减震在重刹时支撑力不足，容易出现明显点头现象，甚至前轮会有一点S型走位的感觉，存在一定安全隐患。前减震阻尼不可调，无法满足对悬挂系统有更高要求的骑行者，他们难以根据不同路况和驾驶风格进行个性化调整。配备的双向电子快速换挡系统，降挡只有在油门收干时才能正常工作，给油或稳定油门时无法降挡，在需要降挡控制车速的紧急情况或弯道驾驶时，可能带来危险。车头灯在夜间的铺路效果差，照明范围短，即使开远光在国道上也不尽如人意，增加了夜间骑行的风险。前刹车上泵手感不理想，前段太空制动太突兀，后段又很软，整体制动不线性，影响刹车时的操控感受和信心。原装轮胎为了追求小赛车风格，抓地力不够完美，对于喜欢激烈驾驶、跑山或追求极限操控的骑手来说，可能需要更换轮胎。在市区拥堵路况下，水温上升迅速，经常达到101℃、102℃，虽然在高速或路况好时水温会下降，但仍需关注这一问题。启动时间相对较长，不像川崎其他车型那样一点就着，给骑行者带来一些不便。作为小排量四缸车型，价格相对较高，但后期贬值空间较大，性价比在后期体现不明显。